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PLOS出版的所有期刊均为自主出版物。

PLOS Biology和PLOS Medicine。这两本期刊均配有专业编辑和学术编辑团队、负责评估待出版的论文。如果向PLOS Biology或PLOS Medicine投递稿件的内容介于基础研究与临床研究之间、这两本期刊的专业编辑会就投稿内容进行讨论、确保尽可能公正地对待稿件、根据讨论结果、编辑可能会建议原本向PLOS Medicine投稿的作者将稿件转投PLOS Biology（反之亦然）。

PLOS专刊。PLOS Computational Biology、PLOS Genetics、PLOS Pathogens和PLOS Neglected Tropical Diseases均由各自的主编和社区编辑部负责、且独立运行。

PLOS ONE。该期刊由社区编辑部负责运营、独立于其他期刊。

论文转投。投稿人可请求把某一PLOS期刊拒收的论文（相关时、附带审阅人报告）转投给另一家PLOS期刊。我们相信、任何一家PLOS期刊的审稿人都希望其他PLOS期刊的编辑考虑他们的审稿报告。只有得到投稿人许可后方可在不同期刊之间转投论文。

为提供期刊的开放获取、PLOS运用独特商业模式、在出版每篇文章时向作者、机构或资助方收取出版费来抵消开支——包括同行评审管理、期刊制作、在线托管和存档的费用。

不同期刊收取的出版费金额也各不相同、只有期刊接受投稿后才收取出版费。

PLOS认为、资金不足并不影响开放获取出版方式。PLOS从一开始就会提供个人费用和机构费用补助项目、目前提供的项目包括：

主要由机构或组织资助的PLOS全球参与倡议会（GPI）为作者研究提供部分（第二类国家）或全额（第一类国家）费用补助、前提是该研究由符合条件的中低收入国家组织或机构提供主要资金支持（至少为文章所含工作的50%提供资金支持）。PLOS GPI规定的第二类国家的作者如果需要其他支持、应向PLOS出版费用资助协会而非PLOS GPI申请。

出版费资助计划针对需要资金支持的作者。不会向期刊编辑或审稿人披露申请人出版费补助申请的具体进展。PLOS出版决策完全取决于编辑标准。

PLOS目前为开放使用科研出版提供两种机构资助项目。参与机构与PLOS签订协议、部分或全额支付机构作者的工作。为了符合项目参加要求、作者应为通讯作者、隶属于“机构账户项目”（全额付费）或 “机构会员资格项目”（免收10%的出版费）覆盖的机构。如果符合“机构会员资格项目”优惠条件且需要其他支持、作者应向PLOS PFA而非“机构会员资格项目”申请。

作者也有资格获得所在机构或资助方的直接资助、这种资助方式与PLOS机构项目不同。查看其他开放近用基金示例。请与文中所述机构联系、确认具体资助金额和具体资格要求。

开放使用协议。向期刊投稿后、作者应表示同意遵守开放使用的[知识共享归属许可协议]（CC BY）授权。根据此授权条款、作者拥有文章版权。不过、只需给予作者及作品来源适当的认可、CC BY授权可允许所有用户下载、打印、摘录、再用、存档和分发此文章。CC BY授权可确保作者的文章被广泛利用、同时可将作者的文章收入任何科学文库中。作者在投稿前应阅读CC BY。

在PubMed中心归档。一旦文章被发表、PLOS会把所有文章存在PubMed中心、此做法符合科研资助机构的相关规定、如美国的NIH、英国的惠康基金会、皇家研究委员会及德国科学基金会、这些机构请求或要求把各自资助出版的文章存放在公开数据库内。

流程。通过邮件联系所有投稿人、从而确保投稿人注意并同意所投稿件的内容及自己的作者身份。部分PLOS期刊同时规定、所有合著者应通过邮件确认自己同意稿件出版。

专业医学作者。出版过程中有专业医学写作者参与的、应公开声明。我们鼓励投稿人查阅《欧洲医学写作家协会指南》、了解医学写作家的作用。

作者资格审核标准。所有PLOS期刊根据《国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）生物医学期刊投稿统一要求》（节选内容如下所示）制定作者资格审查标准。必须提及所有作者对投稿的贡献、如贡献不足以具备作者资格的、应在文章“致谢”部分提及。

作者资格变更。PLOS期刊遵守COPE guidelines关于作者资格变更的规定。在向PLOS期刊初次投稿后、且在稿件正式出版前的这段时间、如有必要变更稿件作者名单、通讯作者应首先与期刊工作人员取得联系并给出变更作者名单的合理原因。如果作者名单变更合理且符合上述“指南”规定、通讯作者向文章的其他作者索要作者名单变更的书面确认函。PLOS应与通讯作者请求在作者名单中添加或删除的个人取得联系。

PLOS关于利益冲突的规定。PLOS承诺尽可能确保公正对待所有研究、也一直践行承诺。不过、人们越来越认识到一点、即每个人——作者、作者所在单位（如学术机构、政府部门、商业公司等）、资助方、审稿人、编辑、出版社——在某些领域存在利益冲突。读者无法客观评判利益冲突是否会导致稿件的内容展示、同行评审和出版决策出现偏差。公开表明利益冲突可让读者更好地评判出现这种偏差的可能性。期刊及其编辑在审稿过程中必须充分考虑一切利益冲突、同时确保所出版的文章声明所有的相关利益冲突。PLOS期刊因此提出以下三条规定：

什么是利益冲突？

PLOS规定、利益冲突是指干扰、或被合理视为干扰投递至PLOS任意期刊的研究或非研究论文稿件的完整、客观展示、同行评审、编辑决策或出版的所有情形。利益冲突包括经济冲突、职业冲突和私人冲突、可能波及组织机构和个人。阅读下文了解各种利益冲突的定义和示例。

哪些人需要声明利益冲突？ 与作者资格、融资、审稿、编辑决策有关的所有人员及出版文章的评论员或评分人都应声明所有及相关利益冲突。

PLOS期刊在审稿和出版过程中如何处理利益冲突？ 所有作者提交《利益冲突声明》后方可就PLOS期刊是否出版投稿做出决策。编辑可能要求作者对利益冲突声明进行进一步说明、作者应阐述文章的所有融资渠道、且必须明确投资者是否参与以下工作：研究设计、数据收集、分析和判读、文章著述和、或投稿出版的决议。如果投资方参与上述内容、应说明投资方的角色/贡献。

如果认定文章作者或投资方声明的利益冲突可能会损害文章所含研究、分析或阐释的客观性和正确性、PLOS期刊的编辑可决定拒绝出版。如果判定某种利益冲突可能导致偏见或合理的认知偏差、PLOS编辑会拒绝出版代写论文及所有非研究论文。判定审稿人的利益冲突会干扰审稿公正性的、PLOS编辑不会就稿件咨询审稿人意见。投稿时或委托他人代写文章时未声明利益冲突的行为会导致编辑直接拒稿。投稿出版后方声明利益冲突的、PLOS期刊会为整篇论文发布正式勘误、必要时会撤销已出版的论文。

经济利益冲突包括但不限于以下方面：

 作者必须声明被视为合理相关、涉及个人或组织机构的所有潜在经济利益冲突。同样、审稿人、学术编辑和职业编辑（有偿或无偿）必须声明可能被视为合理相关、和/或可能影响审稿客观性的任何经济关系；如果存在经济利益冲突、上述人员应停止参与论文。希望评论或者为已出版论文打分的任何人员都应披露所有相关经济利益。在研究调查开始前或结束后的5年中、或在论文编写前后5年中、又或是在文章所述事件出现的前后5年中、建议声明在这期间出现的一切利益冲突。不过、在上述时间框架外也可能出现相关的利益、一旦出现、应及时声明、从而让期刊编辑部评判其相关性。

非经济利益冲突包括但不限于以下方面：

职业利益冲突：

个人利益冲突：

作者、审稿人、编辑及希望评论已出版文章的任何人员都应披露可能影响论文报告、处理或审核稿件、或可能因文章出版而受到积极或消极影响的所有非经济利益。

例如、所有作者需要声明自己是否曾在或现就职于所投期刊的编辑部、是否曾在相关法律程序中担任鉴定证人、是否曾担任或现担任可能从文章出版中受益的机构组织的委员会成员。

审稿人应声明是否曾持有所审文章作者的单位（科研机构或组织）的科研经费、或是否曾与稿件作者合著论文或一同共事、是否与稿件作者存在竞争关系。

同样、因与稿件作者存在个人关系、无法客观评审某一稿件时、编辑——学术、职业、有偿或无偿编辑——不得发表任何审议意见。

最后、为PLOS已出版论文进行评论或打分的任何人员应在公布评论和/或评分时声明非经济利益冲突。

关于进一步澄清的相关事宜请查看：“PLOS医学编辑（2008年）充分理解非经济利益冲突”。PLOS Med 5（9):doi:10.1371/journal.pmed.0050199。

涉及人体试验的调查研究。涉及人体试验的任何调查研究都应得到作者所在机构伦理审查委员会或等效委员会的批准、并应在文章中注明上述审查委员会。对于涉及人体试验的调查研究、应持有“知情同意书”（或解释没有知情同意书的原因—例如、研究数据的分析是在匿名条件下进行的）、同时应根据《赫尔辛基宣言》规定的原则开展所有临床研究。经要求、文章作者应能够出示研究伦理委员会或机构伦理审查委员会签发的《研究批准声明》。PLOS编辑鼓励作者提交病人知情同意书样本、且在特殊情况下要求作者必须提交。

如果研究涉及人类种族/民族、年龄、疾病/残疾、宗教、性别、性取向或其他社会建构分组、文章作者应尽可能：

此外、应及时修改过时术语和可能具有污蔑性质的标签、使用更现代、更易于接受的术语——例如：应用‘白种人’或‘【西方】欧洲后裔’（必要时）代替‘高加索人’；用‘癌症患者’代替‘癌症受害人’。

动物研究报告和善待动物。涉及动物研究的所有工作都应符合相应的国家和国际标准指南。应事先从相关作者机构或其他相应的道德委员会手中获得研究设计的批准函、同时在投稿时注明机构名字和批准函编号（见下文）。对于涉及非人灵长类动物的研究、应根据Weatherall（2006年）报告非人灵长类动物在研究中的应用的建议进行。如果使用未经调节的动物或某一委员会并未要求获得道德批准、文章应对这一情况进行明确说明并解释无须进行道德审批的原因。

与此同时、我们真诚鼓励所有作者遵守NC3Rs制定的动物研究：体内试验报告（ARRIVE）指南、从而提高试验报告标准、确保动物试验数据得到充分审查和利用。ARRIVE指南规定、应在文章的特定板块（如标题、摘要或方法板块）包含相关信息。ARRIVE指南适用于使用实验动物的所有生物科学研究。如果因该研究与人类临床研究有关、容易引起误解、则应在文章标题中注明动物模型

伦理批准函样本:This study was performed in strict accordance with the recommendations in the Guide for the Care and Use of Laboratory Animals of the National Institutes of Health. The protocol was approved by the Committee on the Ethics of Animal Experiments of the University of Minnesota (Permit Number: 27-2956). All surgery was performed under sodium pentobarbital anesthesia, and every effort was made to minimize suffering.

作者同意他人在合理情况下免费使用文章中的所有资料和信息后、PLOS期刊才批准出版。

PLOS期刊要求作者无限制地允许他人使用文章调查结果中的所有数据、个别情况除外(1)。

在线投稿时、文章作者应提供一份符合PLOS规定的《数据可用性声明》。如果投稿被期刊采纳出版、《数据可用性声明》应附在文章结尾部分。

根据PLOS规定、一旦作者拒绝分享数据、相关元数据和方法、编辑有理由拒稿。如果研究人员在使用PLOS期刊已出版文章数据时遇到困难、PLOS期刊编辑鼓励研究人员及时联系期刊编辑。文章出版后发现数据获取存在限制、我们有权发布勘误、联系作者所在单位及赞助方、在极端事件中、我们也有权撤销出版。

下文列出PLOS期刊接受的数据共享方法、数据可用性声明应含事项及遵守申报最佳操作规范的方法。如果作者并未自行收集数据而是利用其它数据来源、应在恰当位置对此数据来源表示感谢。如果作者对PLOS政策存在疑问或疑惑、或读者难以获取数据、建议与相关期刊办公室取得联系或发送邮件进行询问（[email protected]）。

数据存储（强烈推荐）。与所投稿件中研究结果有关的所有数据和元数据应存放在适当的公共资源库中(2)、已在所投稿件中呈现的除外。资源库可以是针对具体科目的（存储在具体科目中）、接受存储结构化数据的具体方式、也可以是综合资源库、接受多种数据存储类型、如Dryad。下文列出了可接受的资源库指南(2)。《数据可用性声明》应规定：在公共区域存储数据、并根据数字对象标识或相关数据集检索码列出资源库名称。在某些情况下、只有PLOS期刊接受作者投稿后、作者才能获取DOIs或检索码；在这种情况下、作者应在期刊接受投稿时提供这些检索码。在其他所有情形中、应在投稿时提供这些检索码。

辅助资料文件中的数据。对于小型数据集或部分数据类型、作者可上传手稿的辅助资料文件。（同时参考辅助资料文件恰当使用的其他说明。）作者应选择能有效获取数据的文件格式（例如、提供列表数据时、电子表格由于PDF格式）、从而优化数据的可获取性和可复用性。

如果数据存储或辅助资料提供的数据违背道德或法律（例如、相关数据会暴露隐私或违法、或包含人体试验(3)）、在具体分析评价中可采用以下两种方法：

如果出现影响数据共享的以下因素、PLOS期刊不会考虑作者来稿：

提供PLOS数据政策常见问答汇编并定期更新。

PLOS规定、“最小数据集”是指用于得出文章结论、含有相关元数据和方法的数据集以及用于复制全文研究结果的其他数据。核心描述性数据、方法和研究结果应包含在论文主要内容中、与数据存储无关。PLOS拒绝接受参考“未显示数据”这种情形。期刊编辑和审稿人应根据具体情况要求部分文章的作者提供特殊数据类型。作者文章所含数据集过大、无法通过资源库或上传文件共享、应咨询相关期刊。

PLOS规定：作者应遵守针对具体领域的数据编制与记录标准、并挑选适合自身领域的恰当资源库、例如在ArrayExpress或GEO存基因芯片数据；在GenBank、EMBL或DDBJ存储基因序列；在ClinicalTrials.gov存储临床试验数据、在Dryad存储生态数据。鼓励作者选择符合相应标准的可靠数字资源库、如符合研究图书馆中心或批准印章数据的标准。大型国际数据的存在期限往往比小型的地方数据更长久。资源库所含数据的版权许可或许并不明朗。如果作者使用含有指定版权政策资源库、此版权政策的严格程度不得超过《知识共享许可协议》（CC-BY）。

对于涉及人体试验的研究、应对数据进行处理、避免侵犯参与者隐私。PLOS建议研究人员遵守既定指南和当地相关法规、避免侵犯参与者隐私。研究人员可以参考的资料包括：

应采取如下措施保护参与者隐私：去除识别信息、拦截数据库的部分内容、签订关于隐私方面的许可协议。作者应在道德声明中列出保护参与者隐私的具体措施。如果许可协议适用、作者应注明其他研究人员获得许可的必要步骤。

PLOS努力确保旗下期刊出版的所有文章的相关资料的可用性、希望让所有人都能随时无障碍地获取与文章相关的所有可替换材料（同时不损害人体研究的保密性）。

如果研究人员在PLOS期刊已出版文章中获取资料遇到困难时、建议研究人员联系PLOS期刊编辑。PLOS期刊已出版某篇文章后发现文章资料的获取存在不合理限制、PLOS有权发布文章勘误、联系作者单位和资助方、在极端情况下甚至有权撤销出版。

PLOS支持研发开源软件、而且认为开源软件是投稿的中心环节、遵守相应的开源软件标准可确保投稿：（1）符合关于详细介绍方法、方便其他研究人员复制试验的规定、（2）与倡导研究对外公开的目标一致、（3）合乎“PLOS期刊出版的所有文章能被未来研究人员充分利用”这一意图。因此、如果最新开发的软件或运算系统构成PLOS论文的核心内容、作者应确保新软件符合开放源码定义、并在开放式软件档案中存储以下三项内容，并在投稿时附在文章辅助资料内。

合格的文档应提供所用软件的公共资源库。无需创建用户账号、登陆或注册个人信息即可查找和下载代码。这类档案包括：SourceForge、Bioinformatics.Org、Open Bioinformatics Foundation (O|B|F)、Google Code、Savannah、GitHub和Codehaus。作者应在文章中提供数据存储软件的直接链接。

与期刊一同存储在开源软件档案中可确保与文章有关的源代码及文章出版后的最新增强功能可用。如果文章所含项目能长时间提供公开源代码、PLOS期刊可考虑出版此文章。期刊接受稿件的一个前提条件是：审稿人通过访问公共软件即可运行此软件；文章中的结果具有可复制性。虽然此软件在运行时不得依赖资源库或其他无法获得的辅助软件、但它可在任何一种读者常用的硬件-软件平台上运行（包括MATLAB）。如果文章所描述的软件需要访问数据库及其他无法长久稳定存在的资源（如缺少资金支持的个人实验数据）、PLOS期刊不会考虑接受这种文章。此外、同行评审人、编辑或读者利用已存储的数据集和现有控制参数运行软件时、文章中的结果应具有可复制性。

如果软件或运算系统并不构成文章中心内容、我们会鼓励作者免费对外开放所有相关资料。

文章作者应登录EQUATOR Network网站查询适合自身研究设计的报导指南、确保在投稿时附有指定的所有辅助资料（核对内容清单、拟定方案和流程图等）。

临床试验。PLOS遵守世界卫生组织关于临床试验的规定：“……把人类参与者或人类群组分

配到一个或多个医学干预组、并评估这些干预对人体健康影响的所有研究……其中干预包括但不限于药物、细胞、其他生物产品、手术、应用辐射处理、医疗设备、行为管理、护理过程变化和预防性护理等。”

PLOS支持国际医疗期刊编辑委员会（ICMJE）在临床试验注册方面的一贯立场。从2005年7月1日发起的所有临床试验都应在对公众开放的登记处注册（也就是在招募患者参与临床试验前）、否则PLOS期刊拒稿。对于在2005年7月1日之前发起的临床试验、只有事先为临床试验注册才能向任何一本PLOS期刊投稿。ICMJE FAQ规定了具体的临床试验注册步骤、而WHO提供了已通过审批的临床注册清单。发现如果发现投稿中含有未注册的临床试验、PLOS编辑有权告知作者单位或伦理委员会。

临床试验作者必须严格遵守适合自身临床设计的CONSORT报道指南、具体可见CONSORT Statement Website。在投稿进入同行评审阶段前、作者应：（1）在论文临床试验注册处记录注册编号和机构评审查委员会、（2）提供临床草拟方案副本和完整的CONSORT清单、作为辅助资料（如果允许、这些文件可与论文一起出版）。论文“图1”应为CONSORT流程图、应在论文中解释偏离临床草拟方案的部分。作者应清楚陈述论文中的知情同意、PLOS有权索要患者的同意书副本。应在论文的方法板块提及CONSORT声明中尚未提及的统计方法或参与者资料。

PLOS支持按照2007年FDA修正法案关于公开披露所有临床试验结果的规定。提前在临床试验登记处中披露结果并不影响PLOS期刊进行同行评审或接受投稿的决定。

系统评价和荟萃分析。系统评价和荟萃分析报告应参考PRISMA声明、由完整的PRISMA清单列表和流程图组成、从而对正文内容进行补充说明。可登录PRISMA Website自行下载清单列表和流程图空白模板。论文作者应在方法部分阐明是否已为系统评价制定草拟方案、如果已制定、请在辅助资料板块提供草拟方案副本。PLOS期刊支持系统评价的前瞻性注册。对其系统评价已进行前瞻性注册（例如在PROSPERO等登记处注册）的作者应在论文摘要处提及注册编号。注册信息和草拟方案应方便编辑和审稿人查阅、一旦文章被发表、注册信息和草拟方案应与文章一同出现在读者面前。

诊断性研究。关于诊断准确性的研究报告应符合STARD的要求。

流行病学研究。关于流行病学的报告、作者应该咨询STROBE倡议。

基因芯片试验。基因芯片试验报告应符合功能基因组学数据协会（FGED）公布的MIAME指南、试验数据应存储在对公众开放的数据库中。

生物和生物医学研究调查清单列表。PLOS建议作者参考MIBBI门户网站（生物和生物医学调查最小资料）、查看生物和生物医学研究申报的规范性清单列表。

动物命名。在出版描述新动物类群名称的论文时，美国科学公共图书馆遵守国际动物学术语命名委员会（ICZN）的各项要求。自2012年1月1日起，国际动物学术语命名委员会仅在满足存档标准并在ICZN官方注册处——动物银行（ZooBank）登记前提下认定在线出版物是合法的。

为正确登记某新动物类群，我们要求原稿包括两项具体的声明。

在结果一节中，全球唯一标识符（GUID），当前为生命科学标识（LSID）形式，应列于新物种名称下，例如：

Anochetusboltoni Fisher sp. nov.urn:lsid:zoobank.org:act:B6C072CF-1CA6-40C7-8396-534E91EF7FBB

你需要联系动物银行来获得一个GUID（LSID）。请尽早完成，以避免在接受原稿时，耽误出版。你负责向我们提供该等信息，以便我们能将该等信息包含在最后出版的文件内。

请将下述内容插入方法一节，作为“命名举动”节：

本文件的电子版本符合修订后的国际动物命名法规中的各项要求，因此，根据该法规的规定，可以从本文件的电子版本处获得其中含有的新名称。该出版的作品和其中含有的命名举措已在动物银行（ICZN的在线登记系统）内登记。可以通过任何标准网络浏览器，将LSID附加在http://zoobank.org/前，确定动物银行LSID，并浏览相关信息。该出版物的LSID为urn:lsid:zoobank.org:pub: XXXXXXX。在期刊（带有国际标准连续出版物号）上出版本文件的电子版本，并进行存档，并可从下述电子文库：PubMed Central、LOCKSS内获得该电子版本【作者插入任何附加文库】。

所有美国科学公共图书馆文章都保存在PubMed Central和LOCKSS内。如果贵组织或你的合著者拥有自己的图书馆书库，我们推荐你亦将所出版的在线文章保存在该书库内，并将名称加入你的文章中。

植物命名。在出版描述新植物类群名称的论文时，美国科学公共图书馆遵守国际藻类、菌类和植物术语命名委员会（ICN）的各项要求。已经就在线期刊中的下述出版物指南达成一致协议——根据法规的规定，我们出版的任何科学植物名称应被视为有效出版的。请注意：这些指南不同于动物命名指南，仅适用于种子植物、蕨类植物和被子植物。

从2012年1月开始，新类群的描述或鉴定可以拉丁文或英文形式做出。这并不影响适用于学名的各项要求，其仍为拉丁文。

从2012年1月开始，根据国际藻类、菌类和植物术语命名委员会的要求，电子版本的PDF代表已经出版的文件。因此，美国科学公共图书馆文章中的电子出版物内含有的新名称，根据该法规的要求，应被视为来自电子版本中有效出版的，因此，无需再提供印刷复本。

点击此处查找与更多最近变更信息。

为正确登记某新类群，我们要求原稿包括两项具体的声明。

在结果一节中，全球唯一标识符（GUID），当前为生命科学标识（LSID）形式，应列于新物种名称下，例如：

Solanumaspersum S.Knapp, sp. nov. [urn:lsid:ipni.org:names:77103633-1] 类型：哥伦比亚。Putumayo: vertiente oriental de la Cordillera, entre Sachamates y San Francisco de Sibundoy, 1600-1750 m, 1940年12月30日, J. Cuatrecasas 11471 (holotype, COL; isotypes, F [F-1335119], US [US-1799731]).

在同意出版你的稿件后，期刊员工应联系IPNI来获得GUID(LSID)，并且，届时，在编制阶段，应将该信息加入稿件内。

在方法一节中，包括一个名为“命名法”的小节，具体如下：

根据国际藻类、菌类和植物术语命名委员会的要求，某作品（带有国际标准连续出版物号或国际标准书号）中的文件（PDF格式）的电子版本代表已经出版的作品，因此，美国科学公共图书馆文章中的电子出版物内含有的新名称，根据该法规的要求，应被视为来自电子版本中有效出版的，因此，无需再提供印刷复本。

此外，已将本文件中含有的新名称提交给IPNI，并由此提供全球名称索引。可以通过任何标准网络浏览器，将出版物中的LSID附加在http://ipni.org/前，确定IPNI LSID，并浏览相关信息。对本文件的在线版本进行存档，并可从下述电子文库：【如果提交所接受的文稿，填入数字文库的名称，例如：PubMed Central、LOCKSS等等】内提供该在线版本 。

所有美国科学公共图书馆文章都保存在PubMed Central和LOCKSS内。如果贵组织或你的合著者拥有自己的图书馆书库，我们推荐你亦将所出版的在线文章保存在该书库内，并将名称加入你的文章中。

菌类命名。在出版描述新植物类群名称的论文时，美国科学公共图书馆遵守国际藻类、菌类和植物术语命名委员会（ICN）的各项要求。已经就在线期刊中的下述出版物指南达成一致协议——根据法规的规定，我们出版的任何科学植物名称应被视为有效出版的。请注意：这些指南不同于动物命名指南。

从2012年1月开始，新类群的描述或鉴定可以拉丁文或英文形式做出。这并不影响适用于学名的各项要求，其仍为拉丁文。

从2012年1月开始，根据国际藻类、菌类和植物术语命名委员会的要求，电子版本的PDF代表已经出版的文件。因此，美国科学公共图书馆文章中的电子出版物内含有的新名称，根据该法规的要求，应被视为来自电子版本中有效出版的，因此，无需再提供印刷复本。

点击此处查找与最近变更相关的更多信息。

为正确登记某新类群，我们要求原稿包括两项具体的声明。

在结果一节中，全球唯一标识符（GUID），当前为生命科学标识（LSID）形式，应列于新物种名称下，例如：

Hymenogaster huthii.Stielow et al. 2010, sp. nov. [urn:lsid:indexfungorum.org:names:518624]

你需要联系Mycobank 或 Index Fungorum来获得GUID (LSID)。请尽早完成，以避免在接受你的原稿时，耽误出版。 你负责向我们提供该等信息，以便我们能将该等信息包含在最后出版的文件内。从2013年1月开始，描述菌类物种的所有文件必须参考原始文献中公认的文库出具的标识符，从而确保有效出版。

在方法一节中，包括一个名为“命名法”的小节，具体如下（该举例适用于提交给MycoBank的类群名称；如果已提交至菌类索引的话，请适当地更换）：

根据国际藻类、菌类和植物术语命名委员会的要求，某作品（带有国际标准连续出版物号或国际标准书号）中的文件（PDF格式）的电子版本代表已经出版的作品，因此，美国科学公共图书馆文章中的电子出版物内含有的新名称，根据该法规的要求，应被视为来自电子版本中有效出版的，因此，无需再提供印刷复本。

此外，已将本文件中含有的新名称提交给MycoBank，并由此提供全球名称索引。可以通过任何标准网络浏览器，将出版物中的MycoBank编号附加在http://www.mycobank.org/MB/前，确定唯一的MycoBank编号，并浏览相关信息。对本文件的在线版本进行存档，并可从下述电子文库：【如果提交所接受的文稿，填入数字文库的名称，例如：PubMed Central、LOCKSS等等】内提供该在线版本 。

所有美国科学公共图书馆文章都保存在PubMed Central和LOCKSS内。如果贵组织或你的合著者拥有自己的图书馆书库，我们推荐你亦将所出版的在线文章保存在该书库内，并将名称加入你的文章中。

向期刊投稿时、所有作者应明确表示未曾向其他期刊投递同一稿件或相关稿件（已由其他期刊接收或正在审核)。如果已向其他地方投递相关稿件、向PLOS投稿时应附带该相关稿件的副本。审稿人应对两者之间的重复部分进行评价。

一旦收到作者投稿、PLOS期刊应询问作者是否希望避开部分学术编辑或审稿人对稿件进行同行评审。只要作者的这种要求不影响对稿件客观的全面评价、编辑部就应同意该要求。关于审稿人的相关职能和其他信息、请仔细阅读PLOS利益冲突规定。

编辑和审稿人应对所投稿件进行严格保密。

PLOS会尽快发布勘误、撤销出版声明及需要注意的内容。我们遵守相关的ICMJE（http://www.icmje.org/）和COPE（http://publicationethics.org/）指南。

如果在线文章中的错误严重影响文章内容或读者对文章的理解（例如、数据展示或数据分析方面的错误）、或影响已出版文章的元数据（如拼错作者姓名）、PLOS应发布勘误声明、记录和纠正文章中的错误。在这些情况下、PLOS应发布附带原文链接的勘误。

在极少数情况下、我们可能选择修改原文然后重新在网上发布。即便如此、PLOS也应发布勘误声明以记录原文的变更内容。

如果作者希望提醒PLOS注意需要发布勘误声明的内容、请作者在邮件（[email protected]）中提供相关信息（期刊名称、文章的全部引用和错误说明）或与相应的期刊办公室取得联系。我们鼓励作者指出文章中的排版错误及不影响文章科学完整性的其他错误。

所有PLOS期刊均为出版道德委员会（COPE）会员、遵守出版道德委员会的行为准则、努力达到出版道德委员会最佳操作指南的要求。

我们将严格调查关于PLOS期刊不正当出版行为（出版前和出版后）的说法、必要时有权联系作者单位、资助方和监管机构。一旦发现不正当出版行为的充足证据、我们会采取相应措施纠正科学记录、可能会发布勘误或撤销声明。PLOS期刊设有期刊道德委员会、由PLOS旗下各期刊代表组成、负责为PLOS期刊制定道德规范、调查具体问题。

下文列出了出版道德中的部分关键内容、并非详细清单列表。如果希望了解更多内容、作者应咨询期刊的具体规定和下文的参考资料。

更多资料请查看：COPE、WAME。

在文章出版前作者可在以下场合展示并讨论科研成果：医学或科学会议、预印本服务器、公共数据库、博客、维基百科、推特和其他传播渠道。不过我们建议作者在未确定PLOS已同意出版投稿并制定禁止期前不要使用或回应这些媒介。尊重媒体禁令有助于确保大众传媒准确报道文章、同时能在出版新文章时为有兴趣的读者免费提供具有完整同行评审痕迹的文章。不过、虽然记者在文章出版前已进行了相关报道、但这并不会影响PLOS期刊关于出版文章的决定。同时请查阅PLOS记者与科学家禁令指南。

制药公司。我们支持GPP2通讯公司赞助的医学研究良好出版规范。

烟草行业。如果烟草公司为研究经费或作者薪水提供全额或部分资助、PLOS Medicine、PLOS Biology和PLOS ONE会拒收此研究的文章投稿。如果想了解这些期刊规定背后的原因、请阅读社论：《PLOS医学编辑》（2010年）doi:10.1371/journal.pmed.1000237。

PLOS承认、一些研究可能被归到“双重用途研究”类型。NSABB对“双重用途研究”做了如下定义：科学目的合理、但被误用后可能对公众健康和/或国家安全带来生物威胁的所有生物研究。PLOS作为一种开放近用出版商、在严格遵守相关出版标准的同时依旧致力于广泛传播科研成果。我们希望出版科研论文带来的益处会超过它所带来的潜在风险。PLOS有权在此背景下考虑作者投稿。除了常规科学筛查后、PLOS内部双重用途研究使用委员会可能也会对此类投稿进行进一步审查。向PLOS投稿的作者应在最初投稿时向期刊办公司披露潜在生物伦理/双重用途研究的内容。

问：为什么要求作者在PLOS期刊上发表文章时必须公开文章所含研究数据？

答：PLOS坚决认为文章中的相关数据应供研究人员免费使用、这种行为合法合理、能最大限度地推动科学进步。数据可用性涉及数据验证、复制、再分析、新分析、二次判读或融入元分析、有利于提高研究的再现性、提升科研投资资金的价值。因此、PLOS认为获取文章所含数据应为科研论文出版过程的一部分。此外、在文章的恰当位置插入数据可减轻作者在查找旧数据、保留老硬盘和答复邮件问询方面的工作。有效的数据共享可带来更多引用、会出现更多合著者和更多机遇。我们深知、部分作者不愿意分享数据、也有一些作者对自己的文章进行设置、拒绝开放使用、不过也相信多数作者发表作品是为了让其他人从中受益。更重要的是、研究人员希望他人查阅和引用自己的文章。方便他人查阅和引用会让所有人受益。

问：此规定适用于哪些数据？

答：此规定涵盖用于得出文章结论的数据集、包括相关元数据、方法及完整复制研究结果所需的其他数据。无需提交所有数据集或调查期间收集的所有原始数据、但必须提交与具体研究相关的部分数据。

问：如果PLOS数据政策并未考虑我的数据类型、我该如何处理？

答：查阅此规定和常见问答后、如果仍对此规定如何规范研究数据存在疑问、请联系相关PLOS期刊或发送邮件进行咨询（[email protected]）。我们会根据具体情况考虑每种情形。

问：如何方便公众获取数据？

答：PLOS强烈推荐在公共资源库存储数据、资源库可以是针对具体科目设定的资源库（如在GenBank存储序列、在clinicaltrials.gov存储临床试验数据、在PDB存储结构数据）也可以是综合性资源库（Dryad、FigShare）或机构性质的资源库、只要提供DOI或获取码、至少可以像CCBY一样对外开放数据。与此同时、也可以通过辅助资料文件（最好使用可有效获取数据的文档格式）或稿件开放数据获取。

问：如果数据集太大无法上传到资源库将会怎样？

答：如果数据集非常大、无法存储到资源库中、我们鼓励作者在向PLOS提交数据可用性说明时详细说明遇到的情形、我们会与作者一起努力、共同寻找解决方案。

问：对外公开数据的例外情形有哪些？

答：对外公开数据的例外情形包括：

问：我的资助机构或政府法律只允许与签订书面协议的研究人员共享人体试验数据。面对这种情况应如何处理？

答：请提供相关研究人员启动数据获取流程所需的个人与机构的联系方式。如果有任何疑问、可与相关期刊取得联系或发送邮件进行咨询（[email protected]）。

问：我的文章受国家隐私标准约束、后者可能会禁止我在PLOS上发布文章、这时候我该如何做呢？

答：PLOS数据政策从未意图凌驾于当地法规、法律和道德框架之上。不过、请注意：作者一旦与除PLOS以外的多家期刊签订协议、就表示作者已准备在收到他人请求后愿意共享数据、对于这种情形、我们非常愿意与相关机构进行合作、帮助研究人员在发布作品时充分了解当地规定并判断自身是否需要采用或宣布数据获取限制。如果这些框架禁止或限制数据公布、作者应在文章出版时向读者披露这些限制。

问：因为涉及隐私、我需要把文章中的数据设置为“收到请求后方可获取”、不过我所在的单位并未成立数据获取委员会、而且IRB不愿意负责这项工作、我该如何处理这种情况？

答：尽管PLOS坚信数据应该免费对外公布、不过也承认确实存在以下情况、即出于保护患者隐私或其他考虑、无法免费向所有人披露数据、还有就是并非所有机构都设有数据获取委员会。如果遇到这种情况、作者向PLOS提交数据可用性说明时应注明自己遇到的具体情形。我们仍在努力寻找这方面的解决方案、一旦制定了标准行动方案、会与面临挑战的作者一起解决问题。我们倡议尚未建立数据获取委员会的学术机构认真考虑这一组织对科研工作和研究人员的重要意义。

问：为了确保未来研究的顺利进行、我希望对自己的数据集进行其他分析。在这种情况下、哪些数据可以免费对外开放？

答：PLOS数据政策列出了需要对外开放的最小数据库。最小数据库包括“用于得出文章结论的数据库、包括相关元数据和方法、以及完全复制研究结果所需的其他数据。”这并不意味着作者需要提交全部数据库或调查所得的所有原始数据、作者只需提供与具体研究相关的部分数据。

问：我不想分享数据、因为其他研究人员利用这些数据集后可能“抢先报道”。

答：PLOS认为文章一旦出版（尤其是在开放近用期刊出版后）、关于研究的相关数据应该方便他人使用。这种观点这并非我们的一家之言、同时也是全球首屈一指期刊的原则；英国皇家协会口号的大致含义是“永远不要太相信某人的话”。很多机构和资助机构（如NIH、英国研究委员会）明确要求出版物中的相关数据应至少保持10年之久、应尽可能地减少获取障碍。

问：投稿时如果无法提供获取码或DOI将会怎样？

答：尽管期刊决定接受投稿、但只有收到获取码或DOI才能进行出版、不过也会出现这种情况、即只有期刊接受投稿后才能收到获取码或DOI。

问：如果数据需要进行同行评审但数据尚未对外公开将会怎样？

答：为方便评审、很多资源库允许私人访问、为出版后的文章制定了对外公布规定。如果上述方法不可行、作者可通过其他渠道提供数据、如用邮件、网络随身碟发送压缩文件包。请联系相关期刊办公室或发送邮件（[email protected]）请求协助。

问：如果提交了个人病患数据元分析会怎样？

答：对于个人病患数据元分析、作者应免费对外开放符合法律规定和道德规范的数据。如果作者不能共享数据、应根据“收到请求后方可获取数据”或“第三方可用数据”规定说明研究所用数据集的获取方法。

问：如何在没有DOI的情况下通过资源库对外公开大量数据？

答：对于从资源库中获取数据（如网站链接、注册码和其他识别信息）这一问题、PLOS鼓励作者提供手中的数据。作者投稿后PLOS会与作者一起协作确定如何最好地公布资料。

问：我无力承担存储大量数据的费用、该如何处理这种情况？

答：如果作者在提供论文所含数据获取路径方面遇到困难、PLOS鼓励作者联系各自所在的机构。很多机构和资助机构（如NIH、英国研究委员会）认同数据共享这种观点并要求必须共享数据、在这种情形下、PLOS鼓励作者投稿并与作者一起合作找到解决方案。

问：没有时间或机构基础设施来存储所有数据时该怎么办？

答：如果遇到困难、建议联系所在机构。如果有任何疑问、请联系相关期刊办公室或发邮件进行咨询（[email protected]）。

问：如果在文章出版后发现无法获取数据或遇到其他问题会怎么样？

答：根据我们当前的规定、我们会与作者沟通、必要时采取行动。如果作者违反我们的规定、我们有权发布勘误、通知或撤销已出版的文章。

问：我的研究分析了定性数据、但患者不同意对外公开他们的所有资料。我该怎么办？

答：关于隐私的数据政策例外条款适用于这种情况。不过、一旦收到请求、至少需要对外公布与研究相关的部分患者资料。如果分享部分资料依旧违反患者的意愿、应告知期刊办公室。

问：我应该用哪种文件格式提供数据？

答：用于提交数据的文件格式应符合所在领域的相关标准。如果没有现行标准、提交数据所用的文件格式应能让用户有效获取数据（如Excel表格优于PDF格式）。

问：我需要汇报某项研究的分析结果、不过根据与合作者签订的协议、我无权分享所有数据、这时我该怎么做？

答：应只公开与自身分析有关的数据；无需分享与投稿内容无关的研究数据。

问：我该如何在Dryad中存储数据并向PLOS提供资料？

答：如果向PLOS生物或PLOS遗传学期刊投稿、应准确上传所投文章并向Dryad上传相关数据；方便编辑和审稿人在评审文章时秘密获取相关数据（见Dryad存储数据指南）。

我们计划把所有PLOS期刊与Dryad合并在一起、不过在当前情况下、如果需要向PLOS期刊投稿、仍需注明只有期刊接受投稿后才可在Dryad查看数据。如果期刊接受投稿、作者需要向Dryad存储数据。不过请一定确认所投稿件的状态为“已接受”、同时注明已出版文章的PLOS期刊。在储存数据时、Dryad会自动发送邮件、提供数据DOI。请利用邮件中提到的DOI与PLOS期刊取得联系、从而将其添加到作者的数据可用性声明中。出版社只有收到作者提供的DOI后才能开始制作出版。

问：我的文章数据以方法和SD进行展示、这些信息是否符合PLOS数据政策？

答：这些资料无法满足PLOS数据政策。方法和SD可用于描述数据、但并不构成数据本身。请提交用于确定论文中提及的方法、SD及其他措施的相关数据。

问：如果我利用图表展示自己的主要成果、那么我需要向PLOS提交哪些资料？

答：请提供生成图表的数据表。

问：我是根据免疫组织化学得出的结果、那么我需要提供所有原始图像吗？

答：作者提供的数据应符合所在领域的标准（服从编辑和同行审稿人的判读）、不过在通常情况下、除提供总计数据之外、作者还需要提供免疫组织化学分析的相关数据。可提供研究所用图像的一份样本、但无需提供所有图像。

问：我在2014年3月3日向PLOS投稿、应遵循哪些数据政策？最新的数据政策与以往的数据政策有何不同？

答：在2014年3月3日前投递的稿件无需遵守新数据政策、无需附带数据可用性说明或数据可用性声明（如果作者愿意附带、我们表示欢迎）。下文提到的PLOS原有数据政策适用于你的投稿：

“PLOS努力确保旗下期刊出版的所有文章相关资料的可用性、希望让所有人都能随时无障碍地获取与文章相关的所有可替换材料（同时不损害人体研究的保密性）。

不过我们也了解、这种希望并非适合所有领域。因此我们与多项具体科目计划进行合作、以制定相关政策。与此同时、作者必须在遵守各自领域关于通过数据库共享数据的最佳操作规范：例如、在ArrayExpress或GEO中存储基因芯片数据；在GenBank、EMBL、DDBJ存储基因序列；在 Dryad存储生态数据。我们倡导作者遵守各自领域关于数据制备与记录的具体标准；更多内容请查看下文（第八部分——具体研究设计申报指南）。如果缺乏针对具体领域的数据库、作者可在Dryad中存储数据。

应在文章出版前将数据存储在已建立的公共资源库中、出版文章时应附带相应的获取码或数字对象标识（DOI）。

如果缺少恰当的资源库、应把数据存储在开放近用机构资源库中、如Dryad等综合数据资源库、或作为辅助资料文件与文章一同出版。如果上述情形均无法实现、请在收到他人请求后允许免费使用数据。

不得只根据专有数据分析得出科研结论。如果利用专有数据得出结论、而且作者不愿意或无法对外公开这些数据、则研究论文中必须包括用于验证结论的公共数据的分析、从而方便他人复制分析并在研究结果的基础上开展工作。数据集可用性或利用的限制条件可能会得到评判、以降低文章的重要意义、并因此对文章的出版决策产生最终影响。应根据《共享出版相关数据和材料》（国家学术出版社、2003年）中提到的原则制定这些要求。

制定出版决策时应考虑未能遵守此规定的行为。如果研究人员在PLOS期刊已出版文章中获取资料时遇到困难、建议研究人员联系PLOS期刊编辑。PLOS期刊在已出版某篇文章后发现文章资料的获取存在不合理限制、PLOS有权发布文章勘误、联系作者单位和资助方、在极端情况下甚至有权撤销出版。”

PLOS新数据共享规定并未改变关于已出版文章数据对外开放的要求、只是新增了关于“数据可用性声明与文章一同出版、数据存储地点会更加透明”的规定。如果有其他问题、请与相应的PLOS期刊联系或发送邮件进行咨询（[email protected]）。

问：如果上述常见问答未能解答我的问题将会怎样？

答：鼓励对数据共享规定存有疑问的作者或在获取数据时遇到困难的读者联系相应的期刊办公室、或发送邮件进行咨询（[email protected]）。

为努力改善同行评审和科学交流的程序、我们就PLOS期刊稿件处理流程开展调研究、如果你是PLOS的一名审稿人、作者或编辑、希望退出此项调研、请与相应的PLOS期刊办公室取得联系。参与此调研既不影响对投递稿件的评审、也不影响PLOS关于作者、审稿人、论文的保密性规定。个人研究项目应符合相应的道德规范和审批流程、必要时、应主动联系相关人员以确定他们是否同意参与此调研。